萃取條件的選擇有幾種情況：一是用同一種流體選擇不同的壓力來改變提取條件，從而提取出不同類型的化合物；二是根據(jù)提取物在不同條件下，在超臨界流體中的溶解性來選擇合適的提取條件；三是將分析物沉積在吸附劑上，用超臨界流體洗脫，以達(dá)到分類選擇提取的目的；四是對極性較大的組分，可直接將甲醇加入樣品中，用超臨界CO2提取，或者用另一個泵按一定比例泵入甲醇與超臨界CO2，來達(dá)到增加萃取劑強度的目的。 

影響萃取效率的因素除了萃取劑流體的壓力、組成、萃取溫度外，萃取過程的時間及吸收管的溫度出會影響到萃取及收集的效率，萃取時間取決于兩個因素：一是被萃取物在流體中的溶解度，溶解度越大，萃取效率越高，速度也越快；二是被萃取物質(zhì)在基體中的傳質(zhì)速率越大，萃取越完全，效率也越高。收集器或吸收管的溫度也會影響到回收率，降低溫度有利于提高回收率。 

超臨界流體減壓后，用于收集提取物的方法主要有兩類--離線SFE及在線SFE或聯(lián)機(jī)SFE，離線SFE本身操作簡單，只需要了解提取步驟，樣品提取物可用其他合適的方法分析。在線SFE不僅需要了解SFE，還要了解色譜條件，而且樣品提取物不適用于其他方法分析，其優(yōu)點主要是消除了提取和色譜分析之間的樣品處理過程，并且由于是直接將提取物轉(zhuǎn)移到色譜柱中而有可能達(dá)到最大的靈敏度。